Estructura de la comunidad bacteriana en sedimentos de manglares en relación a variables medioambientales mediante análisis de fragmentos del gen 16S rRNA y electroforesis en geles desnaturalizantes
DOI:
https://doi.org/10.3989/scimar.2009.73n3487Palabras clave:
comunidad bacteriana, sedimentos de manglares, electroforesis de gradiente de gel desnaturalizante, analisis estadistico multivarianteResumen
La estructura de la comunidad bacteriana y la relación entre variables ambientales y las comunidades microbianas de la superficie de sedimentos de los ecosistemas tropicales de manglares fueron investigados en Sanya, Hainan Island, China. Los perfiles de las comunidades bacterianas fueron obtenidos utilizando electroforesis de gradiente de gel desnaturalizante (DGE), cultivo-independiente, y los resultados fueron interpretados con un análisis estadístico multivariante. Los resultados sugerían que las comunidades microbianas variaban con los lugares de muestreo y las estaciones. Las muestras recogidas en el mismo lugar de muestreo y al mismo tiempo tenían comunidades microbianas similares, excepto las muestras SH3 y AB5, que tenían diferente calidad de sedimentos. El análisis de correspondencia (CCA) mostró que la concentración de carbono orgánico en sedimentos explicaba una parte importante de la variabilidad en la composición de la comunidad bacteriana. Los análisis filogenéticos fueron usados para identificar los grupos más importantes de filotipos predominantes de bacterias. Se secuenciaron fragmentos 16 rRNA gene-V3 de 17 bandas individuales de DGE y las bacterias correspondientes fueron encontradas por primera vez en sedimentos de manglares en base a resultados de BLAST. Los filotipos de bacterias predominantes se agrupaban con varios grupos taxonómicos que incluyen Proteobacteria, Bacteroidetes, Gemmatimonadetes, Actinobacteria y Firmicutes.
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